2018年9月7日全国乒乓球锦标赛开赛之即，樊振东因病正式退出全国锦标赛各项比赛。随后樊振东将返回北京接受治疗。樊振东的突发退赛使全锦赛的精彩程度降低不少，同时广大球迷也对樊振东的身体状况担心。

9月6日21：45樊振东吧的官方微博“樊振东吧-天际樊星”宣布樊振退赛消息：“经过沟通了解，小樊因身体原因退出本次全锦赛。之后会返京治疗并备战之后的比赛，请大家放心。你的健康比什么都重要，下个比赛见！明日应援物会在现场正常发放，请大家继续为解放军队加油！”

据了解，樊振东在此前的亚运会备战期间得了很严重的湿疹。因为要参加亚运会的关系不敢随便用药，一直饱受疾病折磨。在这种情况下，樊振东依然咬牙坚持率队夺得亚运会男团冠军和男单冠军。

在之前的照片中，许昕、方博等人都穿着短袖，而樊振东一直穿着长袖衣服。现在看来就是为了遮挡手臂上的湿疹。此次全锦赛樊振东仍然要参赛，人已经到达鞍山进行备战，但病情加重只得返京治疗。

另外，国际乒联职业巡回赛积分榜樊振东虽然排名第二，但之前只参加过3站比赛未达到总决赛要求的5次标准。现巡回赛只剩下10月份的瑞典公开赛、11月份的奥地利公开赛两站比赛，樊振东必须全部参加才有资格打总决赛。距10月份的瑞典公开赛仅剩1个多月时间，希望樊振东病情不要影响到这次参赛。