10月1日，MotoGP世界摩托车锦标赛在日本茂木赛道结束了周日大奖赛的角逐。在一场赛道逐渐变湿的比赛中，马丁一度犯错掉到第六的情况下，一点一点地完成超越，最终又一次率先冲线，获得日本大奖赛胜利！巴格尼亚紧随其后获得亚军，而马奎兹今年首次在周日登上领奖台。

正赛于14:00准时进行，而在比赛开始前现场出现了小幅度的降雨。在暖胎圈结束之后，雨势加大，但比赛仍然照常进行。正赛的起步和冲刺赛几乎一模一样，马丁率先进入1号弯，KTM双雄米勒和宾德上到第二和第三。贝塞奇想在内线完成超越，但身前的巴格尼亚已经并线进弯，贝塞奇不想追尾巴格尼亚于是被迫放弃入弯，但这导致外线的维纳里斯和扎科无法躲闪，两位车手都进入砂石地，扎科能够直接回到赛道，但维纳里斯摔在了地上没法重启摩托车。

出2号弯后，巴格尼亚很快反超了宾德回到第三。马奎兹在3号弯跑大，被大E超越掉到第六。而大E在第一圈干胎湿地的情况下速度飞快，超越宾德之后上到第四，随后很快就向巴格尼亚发起冲击，两位车手在并排了好几个弯角。进入11号弯，米勒超越马丁上到领先位置，巴格尼亚顺势完成超越来到第二。大E在出弯的地方过于小心，从第四掉到第六，宾德和马奎兹都重新完成了超越。

位列前11 的车手在第一圈结束后全部进站，大E在进站口冲得很凶，从第六重新杀到了第三。而在总共15位车手换上带有雨胎的备用摩托车后，皮罗、夸塔拉罗、布拉德尔、莫比德利和克劳奇罗5位没有进站的车手成为了干胎的领先集团。

进站的情况十分混乱，维修区出口一度呈现了五车并排的情况。巴格尼亚通过一个很快的换车其实翻到了最前面，但他却在出口像是睡着了似的，没有及时提速，直接掉到了雨胎阵营的第五，马丁、大E、马奎兹和米勒接连完成超越。而损失最大的则是宾德，进站前他位列第五，进站后他掉到了倒数第三！获利最大的是贝塞奇，进站前他在一个非常糟糕的第一圈后掉到了第十，而出站之后他已经上升到了雨胎阵营的第六位。

进入3号弯，米勒错过刹车点没有抱住弯心，他也被巴格尼亚超越，掉到了雨胎阵营的第五位。大E在7号弯超越马丁上到雨胎阵营的领先位置，但马丁在几个弯角后迅速完成反超，重新拿回了位置。贝塞奇在10号弯出弯完美，轻松地在接下来的直道上超越巴格尼亚上到雨胎阵营的第四位。

第二圈结束后，夸塔拉罗和克劳奇罗也无法坚持，进站换车，他们掉到了垫底的位置。皮罗、布拉德尔和莫比德利继续坚持。领先雨胎集团的马丁在3号弯犯错冲出赛道，他也因此掉了五个位置，被大E、马奎兹、贝塞奇、巴格尼亚和米勒接连超越。而莫比德利的速度非常慢，已经掉到了雨胎阵营的身前。马奎兹抓住机会想要超越大E，但他却在11号弯错过刹车点跑得太深，立刻被大E反超。马丁则很快找回了节奏，超越米勒之后回到雨胎阵营的第五位。

进入第四圈，布拉德尔也进站换车，莫比德利此时的圈速比雨胎车手慢了将近10秒，十分挣扎。另一位用干胎尝试继续跑的是皮罗，他的圈速比莫比德利更快，但也比雨胎车手慢了5秒左右，接下来也选择进站换车。巴格尼亚在11号弯获得完美出弯，反超贝塞奇回到第三。

当赛道彻底变湿过后，杜卡迪阵营的车手开始提速了，尤其是马丁，他接连超越了贝塞奇和巴格尼亚。而在位列前两名的大E和马奎兹接连滑落位置的情况下，马丁重新回到了第一。巴格尼亚、贝塞奇和奥利维拉也过掉了大E和马奎兹，他们掉到了第五和第六。进入第8圈，马奎兹也超越了大E上到第五，看起来使用软胎后轮的大E节奏很不理想。在换车阶段掉到队尾的宾德一度上到了第十，但他却在3号弯大力锁死前轮，直接摔出了赛道，成为今天第一位退赛的车手。起步阶段卷入事故的维纳里斯回到了比赛当中，但他已经落后两圈。

马丁在重新上到领跑位置后开始逐渐扩大差距，他已经领先巴格尼亚1秒，而巴格尼亚也领先身后的贝塞奇超过1秒，并没有后顾之忧，前三看起来十分稳定。米尔和米勒则展开了激烈的争夺，也让身前的大E略微可以喘息一段时间。终于，米尔的施压得到了效果，米勒在11号弯的重刹区前轮彻底锁死，从第七掉到了第十，米尔也趁机上到第七。

第11圈，马奎兹在1号弯超越劳尔·费尔南德斯上到第四，大E也开始提速，拉开了和身后米尔的差距，看起来在雨势持续水雾变大的情况下，更软的后轮雨胎开始找到更好的抓地力，大E随后也超越了奥利维拉上到第五。维纳里斯、克劳奇罗和劳尔·费尔南德斯由于错误的换车流程被罚长圈，前两位都在积分区外，而劳尔·费尔南德斯从第九掉到了第十二。

比赛过半，马奎兹开始追赶身前的贝塞奇，尝试为领奖台发起冲击，而他的队友米尔则遇到了一些麻烦，从第七掉到了第十六。位列第六的奥利维拉则由于头盔设置错误，在雨势变大后完全没有任何能见度，被迫进站退赛。马奎兹则很轻松地超越了贝塞奇上到第三，后者开始被大E追赶。

第13圈，由于雨势过大赛道环境过于恶劣，赛会出示了红旗。而在比赛初期卷入事故掉到垫底的扎科一度上到第六，却在红旗前半圈摔车，非常无奈。扎科想尽一切办法把一台受损十分严重的摩托车骑回了维修区，但赛会却禁止他继续比赛，因为他没有从正常的维修区入口回站。此外，被套圈的维纳里斯和此前刚刚进站的奥利维拉都可以回到比赛中，但他们由于被套圈将被迫从维修区发车，17位车手将从发车格上正常起步，前三分别是马丁、巴格尼亚和马奎兹。

在20分钟的红旗过后，赛会开放了维修区，比赛也开始重启。然而，在重启的暖胎圈里，赛道又一次迎来了强降雨，这意味着赛会再次出示红旗，日本大奖赛提前结束。由于在红旗前已经跑完了半程（12圈），获胜的马丁将获得全部的25个积分，巴格尼亚拿到亚军，马奎兹在今年首次于周日大奖赛站上领奖台！

详细成绩单见下：